Marcela, una activista en profundo duelo tras el asesinato de su esposo, intenta explicarse el crimen ocurrido cuando ambos filmaban un documental sobre el ecocidio perpetrado por la minería ilegal en la región de Madre de Dios, Perú, donde, violando las normas ambientales y en complicidad con funcionarios del gobierno y grupos criminales, los mineros extraen oro de los lechos de los ríos. A pesar de la tragedia, Marcela decide continuar con el proyecto documental y se sumerge en un viaje tanto físico como emocional por la Amazonía. Pero la misma película que su marido dejó inconclusa podría revelar al homicida, alguien que Marcela no imaginaba y que pondrá en evidencia que la violencia ha infectado también el corazón mismo de los pueblos amazónicos.

Con un ritmo espectacular, que se adentra además en el pasado de los protagonistas y sus más oscuros miedos, Madre de Dios es un ecothriller que revela el espantoso atentado que se comete todos los días contra el bosque tropical más extenso del mundo.