La situación de la UNMSM está expresada en la simbiosis de tres asuntos vinculantes: La investigación científica, la formación profesional y la gestión de la universidad.
En el contexto de la interrelación de estos tres asuntos Ejes, encontramos a San Marcos inmersa en una cruda realidad; teniendo todo –tradición, prestigio, recursos- San Marcos debía ser la mejor universidad del Perú y una de las mejores de América Latina. Empero, San Marcos es una más de las tantas universidades que hay en el Perú y esta silenciada en el mundo.