En este segundo tomo hemos incluido el Cuaderno 3: “El nivel tisular de la actividad psíquica”, el Cuaderno 4. “El nivel funcional de la actividad personal”, y el Cuaderno 5. “El nivel inconsciente de la actividad personal”. El autor analiza en el Cuaderno 3 el nivel metabólico o la organización estructurada superior a las células: las relaciones intercelulares.  En el Cuaderno 4 realiza, una evaluación crítica de lo que actualmente se conoce como neuroanatomía del sistema nervioso humano. En el Cuaderno 5 explica el psiquismo, la presencia de la corteza cerebral o la estructura laminada de neuronas. De esta manera el autor avanza en su nueva propuesta de comprender la estructura y actividad del sistema nervioso humano.